Setelah meninggalkan jabatan publik, Tom mendirikan Consilience Policy Institute, yang beroperasi di Singapura.
Hubungan Tom dengan Anies Baswedan mulai terjalin pada tahun 2021 ketika ia diangkat sebagai Ketua Dewan PT Jaya Ancol, posisi yang diberikan oleh Anies saat menjabat sebagai Gubernur DKI Jakarta.
Menjelang Pemilihan Presiden 2024, Tom Lembong berperan sebagai Co-Captain Tim Nasional Pemenangan Anies Baswedan dan Muhaimin Iskandar (Tim AMIN).
Baca Juga: Tempat Wisata Alam Seru di Sukabumi yang Letaknya Gak Jauh dari Bogor, Cocok buat Healing
Namun, karier Tom Lembong kini terancam dengan penetapan sebagai tersangka dalam kasus dugaan korupsi terkait impor gula yang merugikan negara hingga Rp400 miliar.